GA與GSP是不同的。主要有以下兩點差異：

（1） 測定的蛋白質類型不同。

GA測定的是白蛋白被糖化的部分，白蛋白的半衰期是明確的。而GSP是把全部的糖化蛋白質為測定對象。白蛋白占血清蛋白的60%，白蛋白以外大量的血清蛋白是免疫球蛋白，GSP可能因為感染癥等原因發生變動。如果因患有其他疾病而導致蛋白質有增減時，蛋白質的量會影響整體的半衰期。特別是除白蛋白以外量最多免疫球蛋白會因疾病而發生大量的變化，而對GSP的測定值帶來影響，這已是廣為所知。

（2）測定值的表示法不同。

GA的測定值是以白蛋白中的糖化白蛋白含有比率來表示的。不受白蛋白以外的蛋白影響，不受蛋白質濃度的影響。而GSP的值是絕對量。蛋白質的濃度因人而異，蛋白質量因人而異，也因糖尿病以外的病患而變化，GSP是一個因人和因病而容易產生變動的指標。另GA不受輸入液成分影響。